La historia clínica de Ortodoncia es un documento de carácter médico legal que contiene el relato escrito de la información del paciente. La historia clínica tradicional puede ser complementada a través de una historia clínica informatizada permitiendo revertir el crecimiento continuo del volumen almacenado y proteger los expedientes de la pérdida y el deterioro. Se realizó un estudio de innovación tecnológica con el propósito de desarrollar el prototipo de una aplicación informática para la gestión de la historia clínica de Ortodoncia. El universo lo constituyen las Clínicas Estomatológicas del municipio Pinar del Río, la muestra seleccionada pertenece a las instituciones piloto Policlínico Universitario “Pedro Borrás Astorga” y Clínica Estomatológica Docente “Antonio Briones Montoto”, ambas del municipio Pinar del Río. Se diseñó un prototipo que define la arquitectura de información y muestra las funcionalidades informáticas de la historia clínica de Ortodoncia para posteriormente implementar el sistema informatizado contribuyendo a un alto grado de informatización, impulso de la innovación, aumento de la calidad de los servicios y beneficios para el paciente y los profesionales.