Se desarrolló un proceso de reingeniería a fin de mejorar al SAGAJ y permitirle su ejecución en un entorno distribuido tipo Grid bajo una herramienta de dominio público denominada Globus Toolkit. El sistema alineador de secuencias mediante algoritmos genéticos o SAGAJ fue desarrollado por López(2002), y consiste en una técnica de exploración evolutiva, que toma como entrada dos secuencias de ADN a fin de detectar zonas de alta similitud, según funciones de aptitud definidas para medir la calidad de los alineamientos. El SAGAJ es un prototipo académico que requería de mejoras en el desarrollo del algoritmo genético, así como en la documentación y exigencias técnicas formales de la ingeniería del software que garanticen su robustez.