Se determinó la expresión diferencial de proteínas de defensa, ADNc y contenido de oligosacáridos en genotipos de caña de azúcar de comportamiento contrastante en la interacción con Sporisorium scitamineum. Al producirse la infección con dicho hongo en caña de azúcar, se indujeron los sistemas enzimáticos Peroxidasas, Polifenoloxidasas, Glucanasas y Quitinasas. Se determinaron, entre las seis y 72 horas postinoculación, las expresiones temporales y espaciales de proteínas relacionadas con la patogénesis por transferencia “Western blot”, Inmunofluorescencia Indirecta e Inmunomicroscopía Electrónica, secuencias de fragmentos derivados de transcriptos con homología a genes asociados con la defensa, estrés oxidativo, vías de señalización por auxinas y etileno, entre otros y se discute el papel de los oligosacáridos en la inducción de respuestas de defensa en genotipos de caña de azúcar de comportamiento contrastante en este patosistema. Se propone un modelo que integra procesos fisiopatológicos relacionados con los mecanismos defensivos de la planta a diferentes niveles, durante las 72 horas iniciales, determinantes para el desarrollo de la enfermedad.