La eliminación de nitrógeno puede llegar hasta el 90% en efluentes de desagües secundarios y el nitrógeno así extraído, puede preservarse en el suelo mismo o dispersarse en la atmósfera a partir de procesos tales como, la adsorción de iones amónicos, fijación por materia orgánica, la incorporación al protoplasma microbiano, la desnitrificación biológica y volatilización amónica por aereación. En la región de estudio se caracterizó fisicoquimicamente; en épocas seca, de transición y húmeda;las aguas subterráneas considerando parámetros de campo, aniones y cationes mayoritarios y principalmente nitrógeno en las formas nitrógeno total, orgánico, inorgánico (nitrato, nitrito y amonio). Se determinó que en los pozos perforados y excavados de la zona, se encuentran contaminados con altas concentraciones de amonio (límite permisible de agua potable de O.M.S. de 0,05 mgL-1) producto de la descomposición bacteriana del nitrógeno orgánico aportado mediante los efluentes de pozos sépticos y lavado de los depósitos de estiércol en época de lluvias. Se empleó herramientas de Sistemas de Información geográfica (SIG) para la evaluación de la distribución espacial del trabajo descrito.