El Virus Papiloma Humano tipo-18 (HPV-18) es uno de los principales responsables del desarrollo de cáncer de cuello de útero. Este virus presenta una prevalencia de 1,1% en la población femenina sana y de 16,5% en cánceres de cuello de útero a nivel mundial y por su importancia clínica ha sido incorporado en la fórmula de las vacunas comerciales. Con el objetivo de contribuir al diseño de nuevas metodologías de detección de HPV-18 se desarrolló una PCR que presentó una especificidad de 1 (IC95% 0,79–1) y una sensibilidad de 0,54 (0,27-0,81). A pesar de su baja sensibilidad para el diagnóstico (valor de referencia: 0,95), la secuenciación del fragmento amplificado permitió un análisis de circulación viral y filogenia. Se identificaron un 86% de variantes genéticas de origen Europeo y un 14% de origen Asiático-Americano. Estos resultados apoyarían la hipótesis de la introducción del virus durante la inmigración europea a la región. Este tipo de análisis representa un salto cualitativo para comprender los procesos de propagación viral a través de las poblaciones humanas. Esta conexión es fundamental para el monitoreo de la infección por HPV en las instancias pre y post-vacunación.