Las células madre cancerígenas (CSCs, del inglés cancer stem cells) son responsables de la progresión tumoral, la metástasis, la resistencia a la terapia antitumoral y la recurrencia, siendo de especial relevancia su identificación y aislamiento. En este trabajo mostramos una nueva metodología de aislamiento de células cancerígenas de colon y mama con características de CSCs en base a su capacidad de adherencia a la superficie de cultivo. La presencia de CSCs en el tumor es responsable, en parte, de la resistencia a las terapias farmacológicas tradicionales que actúan frente a células con altas tasas de división celular. Por lo tanto, es necesario desarrollar nuevas terapias dirigidas frente a estas subpoblaciones. Por otro lado, mostramos diferentes análisis bioinformáticos con el fin de seleccionar varios microRNAs (miRs) relacionados con el fenotipo CSC que fueron finalmente validados en diferentes subpoblaciones. Estos diferentes perfiles de expresión alientan a futuras investigaciones para el uso de los miRs seleccionados con valor pronóstico y/o terapéutico en el ámbito clínico.